lir.algorithms package

Submodules

• lir.algorithms.bayeserror module
  • ELUBBounder
    • ELUBBounder.calculate_bounds()
  • calculate_expected_utility()
  • elub()
  • plot_nbe()
• lir.algorithms.bootstraps module
  • Bootstrap
    • Bootstrap.apply()
    • Bootstrap.fit()
    • Bootstrap.fit_apply()
    • Bootstrap.get_bootstrap_data()
  • BootstrapAtData
    • BootstrapAtData.get_bootstrap_data()
  • BootstrapEquidistant
    • BootstrapEquidistant.get_bootstrap_data()
• lir.algorithms.devpav module
  • devpav()
• lir.algorithms.invariance_bounds module
  • IVBounder
    • IVBounder.calculate_bounds()
  • calculate_invariance_bounds()
  • calculate_invariance_delta_functions()
  • plot_invariance_delta_functions()
• lir.algorithms.isotonic_regression module
  • IsotonicCalibrator
    • IsotonicCalibrator.apply()
    • IsotonicCalibrator.fit()
    • IsotonicCalibrator.fit_apply()
  • IsotonicRegression
    • IsotonicRegression.fit()
    • IsotonicRegression.set_fit_request()
    • IsotonicRegression.set_score_request()
    • IsotonicRegression.transform()
• lir.algorithms.kde module
  • KDECalibrator
    • KDECalibrator.apply()
    • KDECalibrator.bandwidth_silverman()
    • KDECalibrator.fit()
  • compensate_and_remove_neginf_inf()
  • parse_bandwidth()
• lir.algorithms.llr_overestimation module
  • calc_fiducial_density_functions()
  • calc_llr_overestimation()
  • plot_llr_overestimation()
• lir.algorithms.logistic_regression module
  • FourParameterLogisticCalibrator
    • FourParameterLogisticCalibrator.apply()
    • FourParameterLogisticCalibrator.fit()
  • LogitCalibrator
    • LogitCalibrator.apply()
    • LogitCalibrator.fit()
• lir.algorithms.mcmc module
  • McmcLLRModel
    • McmcLLRModel.apply()
    • McmcLLRModel.fit()
  • McmcModel
    • McmcModel.fit()
    • McmcModel.transform()
• lir.algorithms.percentile_rank module
  • PercentileRankTransformer
    • PercentileRankTransformer.fit()
    • PercentileRankTransformer.transform()